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三代宏基因组测序

浏览次数:499|来源:飞凡检测 | 2022-03-02 10:56:44

宏基因组学(Metagenomics)又叫元基因组学、微生物环境基因组学。是直接从特定环境样本中提取全部微生物的总DNA(也称宏基因组,metagenome),对其进行高通量测序、序列组装和基因注释,获得环境微生物基因组信息总和,以研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能以及代谢通路等。摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势,其应用渗透到各个领域, 包括医学、农业、畜牧、环境等。

近年来,新一代测序技术(Next Generation Sequencing)的发展使研究宏基因组的方法也已经发生了变化,人们可以较快速准确的得到大量生物数据和丰富的微生物研究信息,从而成为研究微生物多样性和群落特征的重要手段。伴随着PacBio测序平台的问世,宏基因组学的研究又增加了一个有力的研究途径,其长读长、无GC偏向和无PCR扩增等优势可以获得更多信息,避免二代测序技术在面对复杂微生物群落时的瓶颈:因读长短、不能跨越重复序列、高GC含量序列等,无法真正揭示菌群的复杂情况。

利用三代实时单分子测序PacBio SMRT技术,大家可以获得更多基因组信息,更准确的物种分类,更多的物种鉴定,较为全面地刻画微生物群落各方面的特性,可最真实的还原环境中微生物群落信息,从而深入探讨它们对于整个生态系统的重要意义。

技术流程

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数据分析

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样本要求

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技术参数

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